1. 测序质量评估分析；

    2. OTU列表生成及注释；

    3. 物种丰度分析；

    4. 物种丰度差异性分析；

    5. 群落结构分析；

1.研究环境中的微生物组成最全面的方案。本技术通过对环境中所有微生物遗传物质的解读，全面分析微生物群体的基因组成及功能，分析微生物群体的多样性和丰度，探索微生物与环境及宿主之间的关系，发掘和研究新的具有特定功能的基因等。

2.研究环境中的微生物组成最具有技术保障的方案：依托高测序平台，进行高通量测序，严格的质控系统保证产出数据质量极高。生物信息学分析内容丰富，除分析环境样品所包含的全部微生物的群体基因组成及功能和参与的代谢通路外，还能对微生物群体的多样性与丰度进行完整诠释，探求微生物与环境，微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。

（一）样品类型

　　1. DNA；样品浓度：≥50 ng/ul；样品总量：>10ug；样品纯度： OD260/280为1.8~2.2，OD260/230≥1.0。

　　2. 组织：菌体取样后置于冻存管中并标注，立即液氮速冻，保存于超低温冰箱中。请尽量使用新制备的样品且样品量至少满足3次以上提取；

（二）样本运输

　　1. DNA样品置于1.5 ml RNase-free离心管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口，干冰运输；

　　2. 菌体取样后置于冻存管中并标注，使用足量的干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。