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MeDIP-Seq全基因组甲基化检测技术

作者:小编 更新时间:2022-05-07 点击数:

  Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing (MeDIP-Seq)技术基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术,采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5′-甲基胞嘧啶抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段,然后通过高通量测序可以在全基因组水平上进行高精度的CpG密集的高甲基化区域研究。可以快速有效地寻找基因组上的甲基化区域,从而比较不同细胞、组织或疾病样本间的DNA甲基化修饰模式的差异。



1、数据产出统计:对测序结果进行图像识别、去污染、去接头,统计结果包括read长度、read数据、数据产量;

2、MeDIP 测序序列与参考基因组序列的比对;

3、MeDIP测序数据的全基因组分布趋势;

4、统计MeDIP测序数据富集区域 ( Peak ) 的信息;

5、基于peak 的全基因组甲基化差异分析。





1、需提供至少30ng的抗体富集后的DNA片段(片段长度200-500bp),为保证实验质量及延续性,请一次提供至少2次样本制备的量;

2、样品浓度和纯度:基因组DNA样品浓度>2ng/μl; OD260/280介于1.8-2.0,无肉眼可见污染;

3、样品保存:请选择乙醇、纯水进行保存,并在样品信息单中注明;

4、样品运输:请将样品置于1.5ml管中,并用封口膜封好。


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